Hoewel het contactonderzoek Covid-19 nog steeds een gemeenschapsbevoegdheid is, is het juridisch kader volledig verschillend van dat van het traditionele contactonderzoek. De Vlaamse overheid heeft voor deze crisis het decreet van 8 mei 2020 tot organisatie van contactonderzoek in het kader van Covid-19 aangenomen. Dat decreet machtigt een extern samenwerkingsverband om het contactonderzoek uit te voeren. Ondanks de gemeenschapsbevoegdheid wordt het overige deel van de organisatie geregeld door het Interfederaal comité testing & contactopvolging, dat ter bestrijding van de corona-crisis in het leven werd geroepen.
De contactonderzoekers van het samenwerkingsverband bellen besmette personen op en doen een risico-inschatting van de contacten van die persoon. Hoogrisicocontacten worden vervolgens gecontacteerd met het advies in zelfisolatie te gaan en aandachtig te zijn voor de symptomen. Deze personen krijgen van de contactonderzoeker per sms een code om een Covid-19 test te ondergaan. Laagrisicocontacten worden ook gecontacteerd en krijgen algemene informatie over hoe een besmetting kan worden voorkomen.
De contactonderzoekers gebruiken voor het contactonderzoek informatie doorgestuurd uit de Covid-19-databank van Sciensano. Die databank is opgericht krachtens het koninklijk besluit nr. 18 van 4 mei 2020. De Covid-19-databank heeft naast contactonderzoek ook het realiseren van wetenschappelijk, statistisch en/of beleidsondersteunend onderzoek, na pseudonimisering, en het meedelen van gegevens aan onder meer het Agentschap Zorg en Gezondheid tot doel, zodat ook het traditionele contactonderzoek kan plaatsvinden.
De informatie komt in de databank van Sciensano doordat de huisarts in de voorziene procedures elektronische formulieren moet invullen die gelinkt zijn aan de databank:
1. bij een laboratoriumaanvraag voor een Covid-19 test;
2. bij een beslissing van de huisarts om ondanks negatieve testresultaten, de patiënt toch te diagnosticeren met Covid-19 gezien de aanwezige symptomen;
3. bij een beslissing van de huisarts om, bij de onmogelijkheid de patiënt te testen, gezien de aanwezige symptomen de patiënt te diagnosticeren met Covid-19.
Doordat alles aan alles gelinkt is, bevat de Covid-19-databank de meest actuele en volledige informatie over de besmette personen en hun contacten.